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ナンノクロロプシスはEPAの豊富な含有量が最大の特徴です。ほかの藻類比較しても各段に多く含み、ビタミンB1、ビタミンC、葉酸などのビタミン類や必須アミノ酸も豊富に含んでいます。また、通常EPAは魚油から摂取しますが、魚を捕獲せずに生産できる環境に優しい健康食品としても注目されております。

食物性のEPAの含有量が高い藻類を主成分としたサプリメントが注目されております。ナンノクロロプシスは、ミドリムシやスピルリナなどの代表的な藻類と比較しても多くのEPAが含まれており、健康と環境面の両面で期待されています。